Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN12Q8IYM2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms