Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM48Q8IWZ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM48Q8IWZ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms