Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37DQ86XT2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms