Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PBRM1Q86U86 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PBRM1Q86U86 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms