Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms