Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RD3Q7Z3Z2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms