Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LYSMD3Q7Z3D4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD3Q7Z3D4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD3Q7Z3D4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms