Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MICAL3Q7RTP6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MICAL3Q7RTP6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms