Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8C5

SYT13, Synaptotagmin-13, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT13Q7L8C5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT13Q7L8C5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms