Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms