Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf139Q6ZV77 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf139Q6ZV77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf139Q6ZV77 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf139Q6ZV77 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms