Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD7Q6ZUT3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD7Q6ZUT3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms