Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms