Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms