Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCIMPQ6UWF3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms