Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF2Q6PJF5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms