Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL35Q6PF15 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms