Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A1Q6PCB7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A1Q6PCB7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms