Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPPQ6IPU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms