Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms