Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC8Q6A555 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms