Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN13Q68D06 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN13Q68D06 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms