Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms