Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms