Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms