Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH2Q5VUJ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms