Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P5Q5VTE0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P5Q5VTE0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P5Q5VTE0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEF1A1P5Q5VTE0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEF1A1P5Q5VTE0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms