Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF220Q5VTB9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms