Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIF1Q5UIP0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms