Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM164Q5U3C3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms