Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGAP40Q5TG30 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGAP40Q5TG30 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGAP40Q5TG30 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP40Q5TG30 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP40Q5TG30 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms