Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms