Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC183Q5T5S1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.9 ms