Protein–RNA interactions for Protein: Q5T481

RBM20, RNA-binding protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20Q5T481 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM20Q5T481 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM20Q5T481 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms