Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC122Q5T0U0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms