Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MARCH8Q5T0T0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH8Q5T0T0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms