Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPANXN4Q5MJ08 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN4Q5MJ08 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms