Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms