Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms