Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFDP3Q5H9I0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFDP3Q5H9I0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms