Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO48Q5FWF7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO48Q5FWF7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms