Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGO1Q5FBB7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGO1Q5FBB7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms