Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf116Q5BN46 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms