Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC178Q5BJE1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms