Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms