Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LACTB2Q53H82 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms