Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms