Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL12Q53G59 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms