Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAN2Q504Q3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAN2Q504Q3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms