Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A4Q4VNC1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms